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Cross-Evaluation of entity linking and disambiguation systems for clinical text annotation
Thorne, Camilo
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Faralli, Stefano
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Stuckenschmidt, Heiner
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DOI:
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https://doi.org/10.1145/2993318.2993345
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URL:
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http://publications.wim.uni-mannheim.de/informatik...
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Weitere URL:
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http://www.slideshare.net/semanticsconference/cami...
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Dokumenttyp:
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Konferenzveröffentlichung
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Erscheinungsjahr:
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2016
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Buchtitel:
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SEMANTiCS 2016 : 12th International Conference on Semantic Systems : Leipzig, Germany September 12 - 15, 2016 : proceedings
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Seitenbereich:
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169-172
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Veranstaltungstitel:
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12th International Conference on Semantic Systems
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Veranstaltungsort:
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Leipzig, Germany
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Veranstaltungsdatum:
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September 12–15, 2016
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Ort der Veröffentlichung:
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New York, NY
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Verlag:
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ACM
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ISBN:
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978-1-4503-4752-5
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Sprache der Veröffentlichung:
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Englisch
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Einrichtung:
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Fakultät für Wirtschaftsinformatik und Wirtschaftsmathematik > Practical Computer Science II: Artificial Intelligence (Stuckenschmidt 2009-)
Fakultät für Wirtschaftsinformatik und Wirtschaftsmathematik > Semantic Web (Juniorprofessur) (Ponzetto 2013-2015)
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Fachgebiet:
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004 Informatik
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Freie Schlagwörter (Englisch):
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Entity linking; semantic annotation; DBpedia; clinical NLP
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Abstract:
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In this paper we study whether state-of-the-art techniques for multidomain and multilingual entity linking can be ported to the clinical domain. To do so, we compare two known entity linking systems, BabelFly and TagMe, that leverage on Wikipedia and DBpedia, with the standard clinical semantic annotation and disambiguation system, MetaMap, over the SemRep clinical word sense disambiguation gold standard. We show that BabelFly and especially TagMe, while achieving decent precision on clinical annotation, outmatch MetaMap's F1-score.
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BASE:
Thorne, Camilo
;
Faralli, Stefano
;
Stuckenschmidt, Heiner
Google Scholar:
Thorne, Camilo
;
Faralli, Stefano
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Stuckenschmidt, Heiner
ORCID:
Thorne, Camilo, Faralli, Stefano and Stuckenschmidt, Heiner  ORCID: https://orcid.org/0000-0002-0209-3859
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