A caveat on the Savage-Dickey density ratio: The case of computing Bayes factors for regression parameters


Heck, Daniel W.



DOI: https://doi.org/10.1111/bmsp.12150
URL: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/b...
Weitere URL: https://www.researchgate.net/publication/328138950...
Dokumenttyp: Zeitschriftenartikel
Erscheinungsjahr: 2019
Titel einer Zeitschrift oder einer Reihe: British Journal of Mathematical and Statistical Psychology
Band/Volume: 72
Heft/Issue: 2
Seitenbereich: 316-333
Ort der Veröffentlichung: Hoboken, NJ
Verlag: Wiley
ISSN: 0007-1102 , 2044-8317
Verwandte URLs:
Sprache der Veröffentlichung: Englisch
Einrichtung: Fakultät für Sozialwissenschaften > Kognitive Psychologie (Seniorprofessur) (Erdfelder 2019-)
Außerfakultäre Einrichtungen > GESS - CDSS (SOWI)
Fachgebiet: 150 Psychologie
Abstract: The Savage–Dickey density ratio is a simple method for computing the Bayes factor for an equality constraint on one or more parameters of a statistical model. In regression analysis, this includes the important scenario of testing whether one or more of the covariates have an effect on the dependent variable. However, the Savage–Dickey ratio only provides the correct Bayes factor if the prior distribution of the nuisance parameters under the nested model is identical to the conditional prior under the full model given the equality constraint. This condition is violated for multiple regression models with a Jeffreys–Zellner–Siow prior, which is often used as a default prior in psychology. Besides linear regression models, the limitation of the Savage–Dickey ratio is especially relevant when analytical solutions for the Bayes factor are not available. This is the case for generalized linear models, non‐linear models, or cognitive process models with regression extensions. As a remedy, the correct Bayes factor can be computed using a generalized version of the Savage–Dickey density ratio.




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ORCID: Heck, Daniel W. ORCID: 0000-0002-6302-9252

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